女性生殖器官主要包括卵巢、输卵管、子宫、阴道和外生殖器官，女性生殖器官发育分两个阶段，即性未分化阶段与性分化阶段，胚胎7周前男性和女性有相同的原始性腺、内生殖器与外生殖器属于性未分化阶段，在胚胎第12周，临床上才可以区别性别，性分化取决于睾丸决定因子和雌激素。
一、性未分化阶段：
1、原始性腺：胚胎卵黄囊处的原始生殖细胞沿后肠肠系膜迁移，到相当于第10胸椎水平处的体腔背部间质中，到达此区域的原始生殖细胞，开始诱导中肾和体腔上皮邻近的间胚叶细胞增殖，进而形成一对生殖嵴。
生殖嵴表面覆盖的一层柱状体腔上皮，在胚胎第6周时伸入间胚叶的组织中，形成性索；
2、内生殖器：略晚于原始性腺，约在胚胎第6周时，起源原肾的中肾管逐渐下行，并开口于原始泄殖腔。此时，在中肾管的外侧，体腔上皮向外壁中胚叶凹陷成沟，形成副中肾管。
胚胎中同时含有中肾管和副中肾管两种内生殖器；
3、外生殖器：约在胚胎第5周，原始泄殖腔两侧组织成褶，并在中线上部融合，形成生殖结节。
尿直肠隔将原始泄殖腔褶分隔成前后两部分，前方为尿生殖褶，后方为肛门褶，尿生殖褶两侧再生一对隆起，称阴唇-阴囊隆突。
二、性分化阶段：
1、性腺分化：若胚胎细胞不含Y染色体，约在胚胎第12周原始性腺发育，原始生殖细胞分化成初级卵母细胞，性索皮质的扁平细胞围绕卵母细胞，构成原始卵泡，卵巢形成。此后，卵巢沿生殖嵴下降，到达盆腔内的特定位置；
2、内生殖器衍变：约在胚胎第8周，若支持细胞未分泌副中肾管抑制因子，则副中肾管不退化，则约在胚胎第9周，双侧副中肾管上段形成输卵管下段，其间的纵行间隔消失，形成子宫阴道管，并逐步发育形成子宫、宫颈和阴道，同时中肾管退化；
3、外生殖器发育：若无睾酮的作用，生殖结节逐步增大形成阴蒂，同时泌尿生殖褶形成小阴唇，阴唇阴囊隆突发育成大阴唇。
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