结局：净天教进攻锁妖塔行动失败，返回净天教总坛，四大家族也返攻上山。当枯木与龙幽交谈之时被唐风发现，刺杀了枯木结果被净天教众人发现，最后被姜世离关押在地牢中。
此时枯木已经觉得那具身体即将陨灭，而瑕的到来令他产生夺瑕的身体作为傀儡的念头。当碰见夏侯彰时，枯木现出身份——夏侯韬，然而枯木没有留情，杀了夏侯彰与其随从。之后，瑾轩赶到，发现枯木与二叔竟是同一人。枯
木解释瑕与夏侯韬是他附身的人选，他们只是他在人界的宿体。本身瑕在十六年前的大地动里已经死去，因为附魂玉在瑕体内才能使瑕存活。当众人打败枯木之后，枯木施展招数假攻夏侯瑾轩，瑕为了保护夏侯瑾轩而丧命。枯木被暮菖兰刺中倒下，魂魄飞离。
三人随后来到司云崖准备安葬瑕，谁知枯木魂魄忽然附身到瑕的身体，刺伤瑾轩与暮菖兰。瑾轩因瑕之前所赠之玉挡住而保住性命，暮菖兰却因此重伤。瑾轩只能孤身一人去找被枯木附身的瑕，并承诺暮菖兰无论生死一定会将瑕带回来，随后找到了枯木。枯木向瑾轩道出了他策划的整个阴谋，瑾轩与其交战。
最终瑕魂魄还有一丝残存使枯木不能施展法术，为了人间的安宁，瑾轩不得已痛苦的用瑕的剑刺向了瑕的身体，瑕的魂魄最终苏醒过来，用自己最后的力气将瑾轩推开致使他不落入悬崖，掉下了山崖。瑾轩落地后，看到瑕落下去后立马跳下山崖，拼命地想抓住瑕的手。随后暮菖兰赶到，崖上却只见一只破碎的毛笔，再不见夏侯瑾轩和瑕。
游戏彩蛋：之后数月，净天教被四大家族和蜀山派围攻失陷，姜世离被封印，血手将神农鼎送往魔界随后被青石、玉书打败。唐风将其女唐雨柔交付给草谷医治。夏侯家因两位门主的去世与少主失踪最后由远房接管逐渐败落。而皇甫卓成为皇甫门主并扶持欧阳家。欧阳倩隐居苍木山，为其子取名姜云凡。暮菖兰一直在等夏侯瑾轩与瑕的归来。当暮菖兰再次来到司云崖来看望他们的时候，突然听到背后有匆匆的脚步声...故事结束。
扩展资料：
角色介绍——
1、夏侯瑾轩
男主角。武林四大家族之一的夏侯家的少主，明州人氏。不喜舞枪弄剑，专爱趣闻逸史，让父亲夏候彰深感恨铁不成钢。好在其二叔夏侯韬（实为魔翳）指导仙术符法，故有所涉略，没沦落到手无缚鸡之力的境地。虽然喜欢读书，博览群书；但他却不是一个死读书、固执己见，有时也会有一些出人意料的鬼点子与异想天开，在遇到问题时，他常能冷静地分析出最合理的解决办法。
2、瑕
女主角。幼时神州大地震，母亲经逢生产，不及逃生死亡，其父在瑕有次长睡不醒误认死亡，在下葬时意外觉醒，使之父女俩被赶出村庄，四处流浪，其父卖艺赚钱为瑕治病之余，仍对于需要帮助之人伸出援手，间接形塑瑕的个性大方、凡事乐观。在父亲因病过世后，投身卖艺以维持生计。
3、暮菖兰
相貌与身材出众的女侠，为了钱不论什么样的委托都会接，一开始怀着目的接近男女主角。但在很爱财的面目下，是个为了村子尽心治病的温柔女儿心。
4、姜承(姜世离)
原欧阳世家的四弟子，为人沉稳内敛，做事认真，不爱多说话，但内在不乏细腻之处，与夏候瑾轩相交十余年，对师傅欧阳英非常尊敬。因为不擅交际，而被大多数同门弟子疏远，又因和欧阳二小姐欧阳倩关系亲密，而遭到同门众多弟子的嫉妒。因魔翳的计谋而被赶出折剑山庄，后被诬陷，在悲愤中更名为姜世离，创立净天教。五前结局被蜀山封印，20年后被其子姜云凡放出（仙剑五正传剧情）。
5、谢沧行(罡斩)
行走江湖的神秘男子，个性悠然自在，不在意小节，脸皮厚，却又粗中带细。喜欢喝酒，因缘际会成为夏候瑾轩护卫之一，对瑾轩等人颇多照顾。实则为蜀山派长老，道号罡斩，喜好与他人比武，乐而不疲，武林四大世家门主均对其头疼，曾与蜀山掌门一贫大战三日三夜而不分胜负，被人评断他的剑术修为堪比昔日剑圣。与师姐草谷互为知心好友。用生命加固蜀山锁妖塔封印后死亡。
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