由于目前没有特效的抗病毒药物，尖锐湿疣的治疗必须采用综合治疗。
（一）治疗诱因：（白带过多，包皮过长、淋病）。
（二）提高机体免疫力。
（三）应用抗病药物。一般只要坚持规则的综合治疗都可治愈。
1、手术疗法 对于单发、面积小的湿疣，可手术切除；对巨大尖锐湿疣，可用Mohs氏手术切除，手术时用冷冻切片检查损害是否切除干净。
2、冷冻疗法 利用-196℃低温的液体氮，采用压冻法治疗尖锐湿疣，促进疣组织坏死脱落，本法适用于数量少，面积小的湿疣，可行1-2次治疗，间隔时间为一周。
3、激光治疗 通常用CO2激光，采用烧灼法治疗尖锐湿疣，本疗法最适用女阴、阴茎或肛周的湿疣。对单发或少量多发湿疣可行一次性治疗，对多发或面积大的湿疣可行2-3次治疗，间隔时间一般为一周。
4、 电灼治疗 采用高频电针或电刀切除湿疣。
方法：局部麻醉，然后电灼，本疗法适应数量少，面积小的湿疣。
5、微波治疗 采用微波手术治疗机，利多卡因局麻，将杆状辐射探头尖端插入尖锐湿直达疣体基底，当看到疣体变小、颜色变暗、由软变硬时，则热辐射凝固完成，即可抽出探头。凝固的病灶可以用镊子挟除。为防止复发，可对残存的基底部重复凝固一次。
6、β-射线治疗 我们应用β-射线治疗尖锐湿疣取得了较为满意的效果，该方法疗效高，无痛苦、无损伤、副作用少，复发率低，在临床上有推广价值。
7、药物疗法
（1）足叶草酯(尤脱欣、鬼臼毒素、疣迪)：本疗法适用湿润区域的湿疣，例如发生于包皮过长而未曾作包皮环切除手术的龟头及会阴部的湿疣。
但对宫颈尖锐湿疣不能用足叶草脂治疗。
用20%足叶草酯酊剂涂到皮损处或用药前，先有油质抗菌药膏保护皮损周围的正常皮肤或粘膜 ，然后涂药，用后4-6小时，用30%硼酸水或肥皂水清洗，必要时3天后重复用药，该药是国外用于本病治疗的首先药，一般用一次可愈。
但有很多缺点，如对组织破坏性大，使用不当可引起局部溃疡。毒性大，主要表现为恶心、肠梗阻、白细胞及血小板减少，心动过速、尿闭或少尿，故使用时必须谨慎，发现上述反应时，应立即停药。
（2）抗病毒药：可用5%酞丁胺霜剂，或用0.25%疱疹净软膏，每日2次，外涂。
无环鸟苷口服，每日5次，每次200mg，或用其软膏外用，α-干扰素每日注射300万单位,每周用药五天。或干扰素300万单位注入疣体基部，每周2次。
连用2-3周，主要副作用为流感样综合症.
（3）腐蚀剂或消毒剂：常用有30%-50%三氯醋酸或饱和二氯醋酸，或18%过氧乙酸。
用10%水杨酸冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸馏水100ml混合溶液，点涂局部，用于龟头、肛周湿疣，每日或隔日一次，效果甚好。
消毒剂可用20%碘酊外涂，或2.5-5%碘酊注射于疣体基部，每次0.1-1.5ml，或用新洁尔灭外涂或以0.1-0.2%外敷，后者需配合全身疗法。
（4）抗癌药
① 5-氟脲嘧啶(5-F u)：一般外用5%软膏或霜剂，每日2次，3周为一疗程。
2.5%~5%氟脲嘧啶湿敷治疗阴茎、肛周尖锐湿疣，每次敷20分钟，每日一次，6次为一疗程。也可用聚乙二醇作基质，加入占其干质5%的5- F u粉剂制成栓剂，治疗男女尿道内尖锐湿疣，也可用5- F u基底注射，多者可分批注射。
② 噻替哌：主要用于5-F u治疗失败的尿道内尖锐湿疣，每日用栓剂（每个含15mg），连用8天，也可将本品60mg加入10-15ml消毒水中，每周向尿道内滴注，保持半小时，副作用有尿道炎。
亦可用本品10mg加入10ml浸泡患处，每日3次，每次半小时，治疗阴茎、龟头冠状沟湿疣，主要用于经其它方法治疗后，尚有残存疣体或复发者。也可将此溶液再稀释两倍浸泡局部，以预防复发。
③ 秋水仙碱：可用2-8%的生理盐水溶液外涂，涂两次，间隔72小时治疗阴茎湿疣，涂后可出现表浅糜烂。
尖锐湿疣药物种类繁多，治疗机理各不相同，使用不当反会加重肝脏负担，因此应该选择性应用。在应用抗病毒药的同时，还应注意查明导致肝，肾功能不良的副作用，标本兼治，才能达到保护身体健康、清除体内病毒的目的。 8．免疫疗法
① 自体活菌疫苗免疫疗法：方法采用手术切取患者自身1～2粒新鲜疣，将病原疣体(HPV病毒)及其代谢产物，经过人工减毒、灭活或利用基因工程等方法制成的用于治疗尖锐湿疣的自动免疫抗毒制剂。
保留了病原菌刺激免疫系统抗病毒的特性。让自身免疫系统便会产生一定的保护物质；产生主动清除病毒能力，达到临床治疗痊愈的目的，当再次接触到这种病原菌时，人体的免疫系统便会依循其原有的记忆，制造更多的保护物质来阻止病原菌的伤害。
结果临床应用4605例，少则1～2周，疣体全部消失，不留痕迹。疗效明显而持久，术后6个月至3年随访，无1例复发。
② 干扰素诱导剂：可用聚肌胞及梯洛龙。聚肌胞每日注射2ml，连用10天，停药1-2月后，再继续用药。梯洛龙每日3次，每次300 mg，停药4天，或隔日口服600mg。
③ 干扰素、白介Ⅱ，卡介素、灵杆菌素，利百多联合应用，疗效较佳。
9.西北农村土郎中用猪油点燃，把轻粉撒在燃油上，产生了烟，病人蹬下让烟熏患处，一般每次5分钟，3--5次就彻底治愈。 中医治疗尖锐湿疣 由于中医治疗取材方便，治疗彻底，目前仍有很多尖锐湿疣患者接受中医治疗。
中医根据患者的体质和疣体的大小，结合全身症状，常划分为3型论治。它们是湿热下注证、外染毒邪证和气血瘀滞证。湿热下注证常发生于素体肥胖，阴部潮湿的患者；外染毒邪证常发生于不洁性交的患者；
而气血瘀滞证主要见于湿疣日久，疣体灰暗的患者。
１、湿热下注证 湿热下注证或有肛周皮损潮湿红润，或有包皮过长，或有白带过多或其他皮肤病。常伴口苦、口粘、口渴不喜饮水，大便粘滞不畅，小便黄。舌红苔黄腻，脉弦数。这是由于肝胆湿热下注，循经流注阴部所致。
治疗宜清利湿热，解毒消疣，方药如下： 苍术10g 黄柏10g 生苡仁30g 土茯苓30g 丹皮10g 通草10g 泽泻10g 马齿苋30g 。方中苍术、黄柏清下焦湿热；生苡仁健脾除湿，具有抗病毒的功能；配土茯苓、丹皮、通草、泽泻、马齿苋解毒除湿，活血化瘀。如湿热重者，可加入龙胆草10g；大便不通者，可加入芦荟10g。
2、外染毒邪证 常见疣体增大迅速，或合并梅毒、淋病，有明确的不洁性交史。自觉症状常较轻或无，舌脉亦可正常。这是由于外染毒邪，毒气蕴滞，故疣体增大迅速。
治疗宜清热解毒，常用方药为去疣三号方加减： 马齿苋60g 败酱草15g 紫草15g 大青叶15g 木贼草15g 。方中马齿苋为主药，清热解毒；配合败酱草、紫草、大青叶、木贼草加强清热解毒、活血散结之效。如皮损灰暗，或病程较长，酌加蜂房、丹参、红花等活血化瘀之品。
3、血瘀滞证 见于皮损暗红或暗褐色，增长缓慢，经久不消，或有疼痛的患者。
舌暗淡，苔薄白，脉细涩。这是由于毒邪结聚日久，阻滞气机，致气血瘀阻所致。治疗宜理气活血、化瘀散结，常用方为桃红四物汤加减： 桃仁10g 红花10g 川芎10g 当归10g 白芍10g 丹参10g 蜂房10g 柴胡10g 夏枯草30g 。方中取桃仁、红花、川芎、当归、丹参、蜂房活血化瘀；柴胡疏肝理气，引药直达病所；夏枯草清热解毒，软坚散结。如患者为气虚者，可加入生黄芪30g，补气解毒，提高机体免疫力；疣体坚硬者，可加入生龙牡各30g以软坚散结。
穿山甲,川黄连,败酱草,赤芍,铁胆粉,海南沉,黄芪,板蓝根,野菊花,生地,茵陈.水煎服或粉碎装零号胶囊,一日三次。
西胡椒30g,薄荷水5g,五倍子20g,共研细末,过100目筛备用.用时取少许药粉敷患处,用手揉搓片刻,局部有麻凉,蛰痛等感觉,其程度因人而异,一般持续15~60分钟,每日用药数次。
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