强直性脊柱炎需与以下疾病进行鉴别，第一是机械性的下腰痛，机械性的疼痛一般在活动时加重，休息时减轻，不伴有胸廓扩张度和脊柱侧弯活动的受限。结核性脊柱炎，症状可以出现脊椎的疼痛，压痛，僵硬，肌肉萎缩，驼背畸形，发热，化验检查可以出现血沉增快，这些与强直性脊柱炎都类似，但是通过x线片可以鉴别，结核性脊柱炎时，脊柱边缘模糊不清，椎间隙变窄，前楔形变，没有韧带的钙化，有时候有脊柱旁结核脓肿阴影的存在，骶髂关节也是单侧受累为主。
银屑病关节炎，二者都容易出现中轴关节受累，但银屑病关节炎一般有银屑病史或其家族史。
强直性脊柱炎疼的原因强直性脊柱炎的发病原因目前还不是十分明确，考虑与以下几种因素相关:遗传因素，强直性脊柱炎具有家族聚集性，HLA-B27基因表达与该病有高度的相关性，但并不是说HLA-27阳性一定会得强直性脊柱炎。
强直性脊柱炎疼痛的原因是局部有非特异性的炎症反应，在病情急性发作期，炎症反应的部位出现大量的炎性细胞聚集，比如中性粒细胞、巨噬细胞等，释放出大量的致炎因子，而导致局部有明显的疼痛感。对于强直性脊柱炎的原因，目前不是太确切，考虑应该是在遗传因素的基础上加上环境因素共同作用的一个结果。中医治疗强直性脊柱炎的方法特别是在针灸方面，比如说用一些调整督脉的针灸方法，起到了较好的止痛和控制病情的作用，强直性脊柱炎主要跟督脉，还有一些肝肾，也就是中医所讲的筋骨一些关系比较密切，因此一些中药制剂，比如说补肝益肾、强筋骨的，都具有调整督脉的作用，也是可以应用的。
强直性脊柱炎中医治疗常用的方法有：中药内服，主要的治疗原则是祛风散寒、活血通络、补肾壮骨，按痹证辨证论治，常用的方剂有独活寄生汤、三痹汤、乌头汤等加减。中医药治疗强直性脊柱炎有很好的疗效，中医认为强直性脊柱炎发生的原因主要是肾虚督寒。
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