1、昆明两个动物园的具体名称不同。两个动物园虽然都在昆明，但是一个动物园名叫圆通山动物园（又名昆明动物园）；而另外一个名叫云南野生动物园。
2、昆明两个动物园的建立时间不同。圆通山动物园建立于1953年，至今已有六十多年的历史；另外一个云南野生动物园2000年，至今只有十余年的时间。
3、昆明两个动物园的具体地址不同。圆通山动物园位于昆明市市区东北青年路北段的圆通山盘龙区青年路92号；而云南野生动物园位于昆明市盘龙区沣源路清水河村（云南省林业厅旁），距昆明市城区中心十公里，毗邻金殿水库。
4、昆明两个动物园的建筑面积不同。圆通山动物园建立比较早，占地面积26公顷；而云南野生动物园的占地2800亩，要比圆通山动物园大很多。
5、昆明两个动物园展出的动物品种数量不同。圆通山动物园现展出200多种3000多只云南特产动物及国内外珍稀动物；而云南野生动物园养殖了200多种约10000多只野生动物，动物展示区展示的动物以云南及中国西部物种为主，突出云南特有的动物。
6、昆明两个动物园的园区内部分布不同。圆通山动物园动物区分为大型动物区、小型动物区、鸣禽动物区、飞禽动物区、水禽等动物区、孔雀园、水族馆并设有海豹表演项目，除了动物区外还有圆通花潮，分为樱花、海棠区，分布在公园中部；
而云南野生动物园分为珍稀动物区、非洲部落、天空之城、天鹅湖、两爬馆、食草散放二区、大熊猫馆、狮虎山庄、孔雀园区等10多个动物观赏展示区，同时还设有多个娱乐休闲景点，园区内开展博物达人、动物学家、自然守护者、华夏五千年、大地之秘等科普教育课程，为孩子提供创造性、娱乐性和教育意义的活动。
7、昆明两个动物园的动物展出方式不同。圆通山动物园的展出动物以圈养方式为主；而云南野生动物园实施自然化的放养、混养，小熊猫、绿孔雀的大群体散放式养殖和展示。
8、昆明两个动物园的门票价格不同。圆通山动物园的成人门票价格为20元/人；而云南野生动物园的成人全票价格为100元/人，身高1.2 米至1.4米儿童，以及学生证和军官证都可以购买优惠门票，身高 1.2 米 以下儿童和70岁以上老年人可以免门票。
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