有内科疗法和外科疗法两种，一般进行内科疗法。
不伴有合并症的十二指肠溃疡，由于即使放任不管也大都自然痊愈，故只要门诊治疗也就可以。不过，对溃疡的治疗，保持身心安静是第一要旨。另外，因为要进行饮食疗法和输液疗法有时甚至还要采取输血等措施，如能住院治疗当然是最理想的。
当十二指肠溃疡有所发展而引起合并症时，以及怀疑有复发和癌变时，因为要进行手术，当然要住院治疗。
内科疗法是在保持身心安静的同时，进行饮食疗法和药物世贺疗法。内科疗法与外科疗法不同，由于复发的比率相当高，所以即使恢复了，也要十分注意。
溃疡的发生与精神紧张有很大的关系，因此在治疗时，要保持身心的安静，解除日常生活中的精神紧张很重要。
对溃疡病的治疗，通过控制胃液中的盐酸和胃蛋白酶的作用，以及加强胃和十二指肠粘膜的抵抗力是有效的疗法。从这个意义上，可使用中和胃酸的制酸剂（碱、氧化镁、氧化铝）和抑制胃液分泌的胃液分泌抑制剂（副交感神经阻滞剂、抗胆碱剂)。为了加强粘膜的防御能力，可使用各种氨基酸制剂、粘膜保护剂等。除此之外，已经开发和使用了抗胃蛋白酶剂、抗促胃泌素剂等。在这些药物中，很早就开始使用的制酸剂和副交感神经阻滞剂，如果长期持续使用，有时会出现副作用，所以要注意。
十二指肠溃疡的治疗非常重视饮食疗法。对饮食进行严格的控制，但通过不降低热量的摄取量，使营养状态良好则可增强抵抗力以促进溃疡的治疗。不过，像酒、咖啡、烟等嗜好品和刺激性较大的香辣调料能促进胃液的分泌，应尽量避免。
十二指肠溃疡患者中，需要手术的是长时间大量出血、穿孔、幽门狭窄、怀疑有癌变者、经内科治疗2～3个月以后仍无好转以及复发等时。也可切除部分十二指肠。
十二指肠溃疡的手术很安全，其治愈率基本上可达100%，也可以说不再复发。
手术后的2～3天期间要禁食，然后逐渐由流食开始，到10天以后，就可恢复普通的饮食。
因各种原因不能住院治疗时，就要在家庭里治疗。在保持安静、药物疗法、饮食疗法等方面同住院治疗是一搜森派样的，但容易出现不彻底的情况而使治疗时间拖长。所以，一定不要麻痹大意，生活一定要有规律，家属也要给予充分的注意。同时要定期去医院检查，请专科医生观察病情。
在休养中，要避免激烈的运动，不外出旅行，为解除精神紧张，可散散步等。不必限制洗澡。
病情恢复以后，对参加工作春芦、结婚、妊娠都没有任何妨碍。不过，由于溃疡是极易复发的疾病，所以一定要努力避免精神紧张，不注意饮食，饮酒、吸烟以及过多地摄取香辣调料饮食等，对溃疡病的复发均有影响。
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