阜阳枢纽是为适应京九全线开通运营的需要建设的，威乡石于1996年8月31日全部竣工，同年9月1日正式投入使用。北起伍明车站，东北至住密严场补开左置着插花站，东南至袁寨站，西面与漯阜地方铁路的阜阳西交接站相连，西南至颍河特大桥，线路全长20.76公里。包括阜阳北编组站、阜阳站、阜阳西站、伍明站、阜阳北车辆段、阜阳北机务段、阜阳机务折返段等。主要新建、改扩建工程内容包括：(1)扩建阜阳北编组站。阜阳北原为一级二场区段站，按三级四场路网性编组站进行扩建，将原有的一级二场的到发场改作上行直通场，既有调车场改建扩大，新建到达场、出发场，远期预留发展双向三级式编组站的条件；(2)改建阜阳站。主要办理客运，站屋规模10000平方米，并增建第三旅客站台及天桥等配套设施；(3全凯仅继移支防缺天什)阜阳蒸汽机车折返段改建为内燃客机折返段，并预留客车整备所位置；(4)新建货车车辆段；(5)青阜线插花站至阜阳北站改线工程及青阜、漯阜与京九的疏解线、联络线等工程。枢纽内主要形厚没连设笔民假工程量有路基土石方388万立方米(均为填方)、桥梁22座4700米、涵洞97座2750米、正站线铺独时异轨131公里、铺道岔222组、道碴42.3万立方米、房屋169乱约皮上世术栋6517平方米以及相配套的给排水、电力、通信、信号等工程，总投资9.1百答卷目九确互训6亿元。无调作业4928辆。阜阳枢纽有效地缓解了京广、京沪两大七免科团南北铁路干线的运输压力，取得了显著的经济效益与社会效益。
京九线开通运营后，大量旅客经由阜阳火车站，走往全国各地，阜阳站的运输压力逐年增加。既有的京九铁路复线，上行线经由阜阳站，而下行线从阜阳北站向东绕城而过。因此，造成阜阳站旅客列车进出京九线，只能依靠上行一保条线路完成，加之阜阳站又是阜淮铁路起始站，相互间交叉干扰，制约了区段的通过能力。2001年12月13日，阜阳铁路枢纽扩能桃园特大桥工程开工。开工兴建此项目，对打通京九线阜阳客运“限制口”，进一步提高作千卷必其误抓犯饭列部阜阳枢纽运输能力，将发挥极其重要的作用。线路走向由阜阳站南端既有的14号道岔引出线路至650米处杨水族武诗力述外换，修建长1229米的跨阜淮铁路和阜颍公路桃园特大桥一座，南接京九线茨园特大桥。
随着阜阳站成为五大民工客源站，春运压力逐渐增大，阜阳枢纽需要进一步建设。2007年，铁道部投资近10亿元改造阜阳枢纽。阜阳站改造工程：新建2个中间站台，客车到发线4条、还建维3条货物列车到发兼调车针线、1条救援列车线，南北咽喉区改造；既有12m宽进站天桥按原标准接长，新建10m宽出站案械化脚相酒素钟井和地道1座，新建6m宽行包地道1职送杆业阻划承苦持处，既有6m宽地道按原标准接占感注长。5个站台中除1个站台按0.5m低站台设置之外，其它均为1.渐代紧25m高站台，新建无站台柱雨棚，以及相关通信、信号、电力、房建、给排水等配套工程。货车外绕线工程：阜阳北（含）至袁寨（含）新建阜淮货车外绕线下行线12.488km、上行线12.616km，阜阳北至阜阳新建京九下行客车联络线3.047km，阜阳北至活印亮守右缺鱼颍南京九货车下行线改线3.0km，相关4条专用线改造，以及相关通信、信号、电力、给排水等配套工程。改造于2008年春运前完成，大大缓解了阜阳站春运压力，阜阳站客运能力提升80%，阜阳枢纽实现了历史跨越。同时，阜阳站原有货运功能由改建后的颍南站承担。
2008年以来，阜阳枢纽建设进入新时期。2008年8月，京九铁路电气化工程上海局管段在阜阳开工。阜阳枢纽、阜淮线阜阳北至袁寨站（不含）电气化改造工程也纳入京九电气化工程，同时对阜阳至九江间线路进行提速改造。2009年12月，京九线上海局管内段电力机车成功首发，阜阳枢纽进入电气化时代。
2008年12月29日，漯河至阜阳铁路复线电气化改造工程开工，涉及阜阳枢纽的工程有阜阳上下行疏解线、引入京九上行联络线、阜阳西站至阜阳站客运通道等。由于涉及上海、武汉两个铁路局的协调，并受到铁路7·23事故对建设资金的影响，原计划2010年底完工的工程工期大大拖延，预计2014年竣工。届时，漯阜铁路将更加顺畅地接入阜阳枢纽，阜阳枢纽的客货运辐射能力将进一步提升。
2009年8月，阜阳至六安铁路开工。该铁路是阜阳～六安～安庆～景德镇铁路的重要组成部分，为单线电气化铁路，设计时速160km/h，预留时速200km/h双线扩建条件。阜六铁路引入阜阳枢纽袁寨站，并新建袁寨疏解线4.3公里。历时四年多的建设，阜六铁路于2013年12月交付通车并开始运营。在商合杭铁路建成之前，阜六铁路为阜阳开行动车组提供了条件，阜阳市政府正积极与铁路部门协商开通阜阳至上海等地动车组。
2010年1月，阜淮铁路、淮南铁路（淮南至合肥段）及水蚌铁路电气化扩能改造工程开工。2013年4月，阜淮铁路电气化竣工验收。至此，阜阳枢纽涉及的铁路除青阜铁路外全部实现电气化。
2013年10月，途径阜阳的商（丘）合（肥）杭（州）铁路项目建议书获得国家发改委批复，预计将于2015年开工。商合杭铁路建成后，阜阳枢纽将进入高铁时代，纳入国家有关规划的京九客运专线、郑合客运专线更勾画了阜阳高铁枢纽的美好前景。
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