齐齐哈尔共有6所大学，名单分别为齐齐哈尔大学、齐齐哈尔医学院、齐齐哈尔工程学院、齐齐哈尔高等师范专科学校、黑龙江交通职业技术学院、齐齐哈尔理工职业学院。
齐齐哈尔医学院（Qiqihar Medical University）位于闻名世界的丹顶鹤的故乡齐齐哈尔市，是黑龙江省特色应用型本科高校和首批“卓越医生教育培养计划”试点高校。
齐齐哈尔医学院创建于1946年，最初为“黑龙江军区军医学校”。历经“黑龙江省卫生学校”、“黑龙江省医士学校”、“齐齐哈尔医士学校”及“齐齐哈尔医学专科学校”等主要发展阶段，1986年升格为“齐齐哈尔医学院”。
截至2017年1月，该校校园规划占地面积110万平方米，建筑面积27万平方米；设有24个教学及教辅机构，本科专业20个；有教职工5570人，共有普教、成教、留学生等各类在校生16703人。
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