该病治疗以抗厌氧菌药物治疗为主。可口服药物，也可阴道内使用栓剂或软膏。孕妇通常需口服药物，而哺乳期以局部用药为宜。妊娠合并细菌性阴道病时，炎治疗细菌细菌性阴肢友道病可以缓解阴道感染的症状和体征，降低细菌性阴道病相关感染的并发症和减少其他性传播疾病感染或人类免疫缺陷病毒（HIV）感染的风险。细菌性阴道病复发者可选择与初次治疗不同的抗厌氧菌药物，也可试用阴道乳杆菌制剂恢复及重建阴道的微生态平衡。并根据病迹袜情适当延长治疗时间。通常没有必姿饥激要治疗患细菌性阴道病女性的男性性伴侣，但细菌性阴道病可以在女性性伴侣之间传播。女性性伴侣应该到医院进行检测，可能需要治疗。药物治疗以下情况医生会使用药物治疗：有症状的患者；妊娠期合并细菌性阴道病；子宫内膜活检、宫腔镜、取放宫内节育器、子宫输卵管碘油造影、刮宫术等须行宫腔操作手术的患者，术前发现细菌性阴道病。全身用药甲硝唑：可抑制厌氧菌生长，不影响乳酸杆菌生长，是较理想的治疗药物。其不良反应主要为胃肠道反应如恶心，呕吐，食欲减退，还有口腔金属味、一过性中性粒细胞减少等，少见过敏样反应（如皮疹、荨麻疹、瘙痒）。由于甲硝唑与酒精结合可出现皮肤潮红，头晕，呕吐，腹痛，腹泻等双硫样反应，故患者在治疗期间以及治疗结束后至少一天内避免饮酒。替硝唑：不良反应比甲硝唑更少，但是在服药期间也不应饮酒。克林霉素：尤其适用于妊娠期患者（尤其孕早期）和对甲硝唑无法耐受、过敏或治疗失败者。局部用药甲硝唑阴道栓，替硝唑栓。克林霉素软膏：将软膏涂抹在阴道处，可能会在治疗期间及停止用药后至少3天内使乳胶避孕套变得脆弱，因而失去避孕的功能。乳酸杆菌栓剂：阴道内用药补充乳酸杆菌，通过产生乳酸从而升高阴道内酸度，抑制加德纳菌及厌氧菌生长，使用后细菌性阴道病复发率较单纯使用甲硝唑治疗低，临床值得推广。手术治疗该疾病一般无需手术治疗。中医治疗该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物可缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
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