从二者的综合实力来看，中国科技大学相对好一些，师资力量更雄厚，下面从多角度进行二者的对比分析：
1、师资力量。
中国科技大学：截至2020年12月，学校共有教学与科研人员2621人，其中教授817人（含相当专业技术职务人员），副教授903人（含相当专业技术职务人员）。
其中，两院院士等高层次人才不重复统计共有496人，占固定教师总数的37%；青年人才占高层次人才的60%。45岁以下青年教师占教师总数的70%，其中35岁以下教师约占青年教师总数35%。
国防科技大学：学校形成了“领军人才+创新团队”的高水平师资队伍，拥有两院院士16人，“万人计划”人选13人，国家杰出青年科学基金获得者9人，百千万人才工程国家级人选24人，国家教学名师、全国全军优秀教师152人，军队杰出专业技术人才奖获得者27人。
军队高层次科技创新人才工程人选74人。有全国创新争先奖奖牌表彰团队1个、国家自然科学基金委创新研究群体2个、国家级教学团队8个、国家级创新团队10个。
2012年学校高性能计算创新团队荣获首批国家科技进步创新团队奖。学蚂悔校自主创新团队被确立为全国重大典型，“慕课”团队被确立为全军重大典型。
2、学科建设。
中国科技大学：学校现有30个学院（学部），含7个科教融合学院；设有苏州高等研究院、上海研究院、北京研究院、先进银念技术研究院、国际金融研究院、附属第一医院（安徽省立医院）。
国防科技大学：据2020年1月学校官网信息显示，学校下辖文理学院、计算机学院、电子科学学院、前沿交叉学科学院、智能科学学院、系统工程学院、空天科学学院、国际关系学院、信息通信学院、电子对抗学院、气象海洋学院、军事基础教育学院、研究生院、第六十三研究所。
开办53个本科专业（包括子方向），形成了以工为主，理工结合，理、工、军、管、文协调发展的覆盖国防科技主要领域的综合学科体系。
3、学科排名。
中国科技大学：在第四轮全国一级学科整体水平评估中，学校获评A、B类学科数各8个，其中，A+档学科数4个、A档3个，A-档1个；B+档6个、B档2个。
A+档学科数列全国高校第11位。信息与通信工程、计算机科学与技术、航空宇航科学与技术、软件工程、管理科学与工程等5个学科入选国家“双一流”建设学科名单。
国防科技大学：在教育部学位与研究生教育发展中心公布的2012年第三轮全国一级学科整体水平评估排名中：该校进入排名前5的学科数为9个（其中理学7个），进入排名前10的学科数为14个；该校数学、物理、生物、天文、地学等基础学科均进入国内高校锋物困学科排名前5。
在学科国际排名方面，根据ESI（美国科学信息研究所“基本科学指标”数据库）对2002年至2012年数据的统计分析，中国科大有10 个学科（数学、物理学、化学、地球科学、生物学、材料科学、工程科学、计算机科学、临床医学、环境/生态学）已进入国际前1%。
其中材料科学、地球科学、工程科学、数学、物理学、化学、临床医学和环境/生态学8个专业领域的学术影响力超过世界平均水平。
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