疣状表皮发育不良主要是表现为全身泛发性扁平疣以及寻常疣。这种疾病患者很小就发生，有的时候可能表现为各种扁平疣损害或者寻常疣损害，发生部位大多是对称分布，好发于面部、颈部、躯干部以及四肢部，也可以泛发全身，有的时候可能表现为寻常疣样损害，有的时候也只是扁平疣样损害。
在临床上大致分为三型，扁平型是最多见的，皮损分布比较广泛，数目较多，而且颜色比较深。另外，也有少见的花斑癣型和点状瘢痕型，这种情况极少见。
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